Informe final del proyecto: Aportes al conocimiento en la circulación de STEC: bases genómicas y determinantes fenotípicos de aislamientos de origen animal, humano, alimentario y ambiental

Abstract

Escherichia coli es un microorganismo ubicuo que se puede encontrar en ambientes diversos y formando parte de la microbiota intestinal de animales de sangre caliente. Además, algunas variantes son responsables de infecciones intestinales y extraintestinales. Las infecciones causadas por E. coli productora de toxina Shiga (STEC) tienen altas tasas de morbi-mortalidad y constituyen un problema de salud mundial. STEC es un patógeno zoonótico y su principal reservorio son los bovinos. La principal vía de transmisión de STEC es fecal-oral. En los rodeos su dispersión se favorece por condiciones inapropiadas de almacenamiento del alimento y escasa limpieza. Además, persiste en alimentos como carne poco cocida y en cursos de agua. Variantes patogénicas de STEC se han detectado en casos de Síndrome Urémico Hemolítico en niños y en terneros en Uruguay. En estos últimos, asociadas a clones altamente patogénicos y portando multirresistencia a antimicrobianos. Para mejorar la comprensión y aportar a la prevención de las enfermedades que puede causar STEC, desarrollamos un proyecto de investigación desde el enfoque “Una salud”, que integra la salud animal, humana y ambiental. Estudiamos las bases genéticas de STEC de diferentes fuentes: terneros, animales silvestres (jabalí y guazubirá), alimentos, agua de arroyo y casos clínicos humanos en Uruguay. Se secuenciaron y anotaron más de 40 genomas de STEC. Determinamos una elevada diversidad de serogrupos, incluyendo variantes altamente patogénicas, que pese a tener diferente origen, presentan un genoma similar. También reportamos una característica específica de patogenicidad denominada isla de patogenicidad LAA. Se especula que su presencia puede estar relacionada con el éxito de STEC para sobrevivir en el suelo o en el agua. Los resultados sugieren la necesidad de incorporar la vigilancia ambiental como componente estratégico en el estudio de STEC, dado que los ecosistemas donde convergen fauna silvestre y actividades agropecuarias constituyen reservorios relevantes para su diseminación.